Relance un spip_loader.php en supprimant auparavant le répertoire tmp, ça devrait te récréer les autorisations et les répertoires.
www/tmp -> 751
www/tmp/cache -> 771
www/tmp/cache/skel -> 777
Et si ça ne résout pas, renomme ton répertoire plugins temporairement et relance spip_loader, puis reprend un à un l’installation de tes plugins dans le BO, il y en a peut-être qui sont bancales.